- تبدیل مرکز تحقیقات بهداشت باروری به قطب پژوهش، آموزش و ارائه خدمات سلامت باروری درسطح کشور و منطقه
- پاسخگویی به نیازهای اساسی پژوهشی در حوزه سلامت باروری
- کمک به سیاستگذاری منطقه ای و کشوری برای برنامه ریزی جهت ارتقاء سلامت باروری جامعه
- دستیابی به جایگاه معتبر و مناسب نسبت به سایر مراکز تحقیقاتی سلامت باروری در سطح ملی و منطقه ای
- طرف اعتماد و مشورت سازمان ها و نهادهای علمی و اجرائی ملی و بین المللی